Gunakan sistem argon kecil untuk mempelajari alur struktur, pengaturan, eksekusi, dan hasil di MD Lab. Ini latihan alur kerja, bukan studi fisika yang sudah tervalidasi.
Masuk dengan akun yang diundang dan hubungkan Komputer Anda di Akun. Biarkan worker dan Docker berjalan.
Buka MD Lab dan buat project bernama Ekuilibrasi argon.
Impor atau bangun struktur argon kecil dengan kotak periodik yang sesuai secara fisik. Periksa jumlah atom, identitas unsur, koordinat, ukuran kotak, satuan, dan massa atom. XYZ dengan spesies Ar atau berkas data LAMMPS yang memuat Masses dapat dipakai; dump yang hanya berisi nomor tipe tidak punya massa untuk dinamika.
Simpan berkas struktur asli serta sumbernya. Pengulangan tampilan tidak menambah atom dalam simulasi.
Tinjau simulasi
Buka drawer konfigurasi dan pilih mode Guided. Pilih model Lennard-Jones bawaan untuk Ar; jangan pakai parameter Generic tanpa mencatat sumbernya.
Pilih resep ekuilibrasi singkat. Periksa temperatur, timestep, batas periodik, seed acak, sistem satuan, parameter potensial, dan interval output.
Jalankan preflight di browser dan baca input LAMMPS yang dibuat. Pastikan struktur dan potensialnya sesuai.
Jalankan sekali dan periksa
Pilih Komputer Anda dan kirim satu run. Ikuti status Queued dan Running pada catatan job serta periksa koneksi worker.
Jika worker offline, hubungkan kembali dan tunggu job yang mengantre; jangan kirim run ganda.
Setelah selesai, buka log, data thermo, trajectory, dan input tersimpan dari project. Periksa error LAMMPS serta apakah perilaku temperatur dan energi mendukung ekuilibrasi yang dimaksud.
Status Completed berarti proses selesai; itu belum memvalidasi force field, timestep, ekuilibrasi, atau kesimpulan ilmiah.
Kegagalan dan pemulihan
Untuk Failed, periksa error LAMMPS pertama yang bermakna dan input tersimpan sebelum mengubah pengaturan.
Untuk Cancelled, tinjau log parsial dan kirim run baru hanya setelah job lama mencapai status akhir.
Jika trajectory hilang, periksa pengaturan output dan artefak tersimpan. Viewer kosong bukan hasil fisika.